В декабре 2011 года Нефтегазовый университет стал победителем в конкурсе поддержки программ стратегического развития государственных образовательных учреждений высшего профессионального образования, подведомственных Министерству образования и науки  Российской Федерации.

Отбор программ развития инновационной инфраструктуры вузов осуществлялся на основе оценки образовательного, научного и инновационного потенциала, финансовой устойчивости участника конкурса, программы стратегического развития и предлагаемых к реализации проектов.  В течение 2012-2014 гг. вуз ежегодно получал на развитие до 100 млн. рублей.

Реализация программы стратегического развития направлена на укрепление позиций университета в российском научно-образовательном пространстве; содействие росту социально-экономического потенциала региона; подготовку квалифицированных кадров всех уровней, способных к творческой и практической деятельности; генерацию знаний и создание инновационных технологий; обеспечение решения задач государственной политики в области социально-экономического развития расположенных на территории Уральского федерального округа субъектов Российской Федерации.

В апреле 2016 года в университете принята новая «Программа развития опорного университета ФГБОУ ВО «Тюменский индустриальный университет».